Охраняемая территория на правом берегу Енисея в междуречье рек Маны и Базаихи. С юго-запада примыкает к городской черте Красноярска. Площадь 47,2 тыс. га, окружающей охранной зоны - 13,5 тыс. га. Основан в 1925 году по инициативе жителей города для сохранения природных комплексов вокруг живописных сиенитовых останцов - Столбов. Становление связано с именем А.Л.Яворского.

Флора включает около 740 сосудистых растений и 260 видов мхов. Преобладает пихтовая тайга, типичная для среднегорья Восточных Саян. Сосново-лиственничные леса; в виде примеси - кедр сибирский. По склонам южных экспозиций проникают степные сообщества Красноярской котловины.

На территории выявлено 290 видов позвоночных животных. Фауна имеет ярко выраженный таежный облик (лесные полевки, соболь, кабарга, гаички, рябчик и т.п.) с включением лесостепных видов (сибирская косуля, степной хорь, длиннохвостый суслик и др.)

Из особо охраняемых видов, занесенных в Красную книгу России, произрастают калипсо луковичное, башмачки настоящий и крупноцветный, пальчатокоренник майский, гнездоцветка клобучкавая, ятрышник шлемоносный, ковыль перистый; обитают скопа, беркут, балобан, сапсан и др. Главная достопримечательность — многочисленные (свыше 100) выходы скал; высота некоторых свыше 90 м. Большинство столбов имеют собственные названия. Наиболее известные находятся в открытом для посещения туристическо-экскурсионном районе заповедника (пл. 1,4 тыс. га.).

В заповеднике ведутся многолетние наблюдения за ходом природных процессов. С конца 1940 годов издано 16 сборников научных трудов. Проведены уникальные работы по фенологии, доместикации глухаря, исследованию биологии кабарги. Изучается влияние атмосферного загрязнения и рекриационного использования на таежные экосистемы.